НашаПобеда.LV | Сокращенные воинские звания
С февраля 1946 года название «Красная Армия» меняется на название «Советская Армия». Звания «красноармеец», «краснофлотец» упразднены в июле 1946 г. с заменой их званиями «рядовой» и «матрос» соответственно. В связи с этим, в годы Великой Отечественной Войны (Второй Мировой Войны) погибшие воины рядового состава сухопутных и военно-морских сил могут считаются увековеченными на мемориалах как красноармеец и краснофлотец.
кр-ц красноармеец
гв.кр-ц гвардии красноармеец
кр.фл. краснофлотец
гв.кр.фл. гвардии краснофлотец
Сухопутные войска
кр-ц красноармеец
гв.кр-ц гвардии красноармеец
ряд рядовой
гв.ряд гвардии рядовой
ефр ефрейтор
гв.
ефр гвардии ефрейтор
мл.с-т младший сержант
гв.мл. с-т гвардии младший сержант
с-т сержант
гв.с-т гвардии сержант
ст.с-т старший сержант
гв.ст. с-т гвардии старший сержант
ст-на старшина
гв.ст-на гвардии старшина
мл.л-т младший лейтенант
гв.мл.л-т гвардии младший лейтенант
л-т лейтенант
гв.л-т гвардии лейтенант
ст.л-т старший лейтенант
гв.ст.л-т гвардии старший лейтенант
к-н капитан
гв.
к-н гвардии капитан
м-р майор
гв.м-р гвардии майор
п/п-к подполковник
гв.п/п-к гвардии подполковник
п-к полковник
гв.п-к гвардии полковник
ген.м-р генерал-майор
гв.ген.м-р гвардии генерал-майор
ген.л-т генерал-лейтенант
гв.ген.л-т гвардии генерал-лейтенант
ген.п-к генерал-полковник
гв.ген.п-к гвардии генерал-полковник
ген.А генерал армии
гв.ген.А. гвардии генерал армии
Военно-Морской Флот
кр.
фл. краснофлотец
гв.кр.фл. гвардии краснофлотец
м-с матрос
гв.м-с гвардии матрос
ст.кр.фл. краснофлотец
гв.ст.кр.фл. гвардии краснофлотец
ст.м-с старший матрос
гв.ст.м-с гвардии старший матрос
ст.2ст. старшина 2-й статьи
гв.ст.2ст. гвардии старшина 2-й статьи
ст.1ст. старшина 1-й статьи
гв.ст.1ст. гвардии старшина 1-й статьи
гл.ст. главный старшина
гв.гл.ст. гвардии главный старшина
м-н мичман
гв.
м-н гвардии мичман
мл.л-т младший лейтенант
гв.мл.л-т гвардии младший лейтенант
л-т лейтенант
гв.л-т гвардии лейтенант
ст.л-т старший лейтенант
ст.л-т гвардии старший лейтенан
кап.л-т капитан-лейтенант
гв.кап.л-т гв.капитан-лейтенант
кап.3р. капитан 3-го ранга
гв.кап.3р. гв.капитан 3-го ранга
кап.2р. капитан 2-го ранга
гв.кап.2р. гв.капитан 2-го ранга
кап.1р. капитан 1-го ранга
гв.
кап.1р. гв.капитан 1-го ранга
- Бронетанковые войска
- Технические войска (химические войска, служба снабжения горючим, ремонтные службы всех родов войск)
- Артиллерия
- Автомобильные войска и водители всех родов войск
- Войска связи и радиотехнические войска
- Инженерные войска
- Медицинская служба (золотистые) и ветеринарная служба (серебристые) всех родов войск
- Военно-строительные отряды
- Музыканты всех родов войск
- Органы военной юстиции
- Интендантская служба всех родов войск
- Авиация
- Авиационно-техническая служба авиации
- Железнодорожные войска и служба военных сообщений
- Кавалерия
- Военно-топографическая служба.
Список сокращений наименований воинских званий, войсковых частей, архивов в Книге памяти о воинах-казахстанцах, павших на территории Австрии в 1941-1945 гг.
: 29 Апреля 2010, 20:18АСТАНА. 29 апреля. КАЗИНФОРМ — АО «НК «Казинформ» впервые начал публиковать список из «Книги памяти о воинах-казахстанцах, павших на территории Австрии в 1941-1945 годах», презентация которой состоялась в Вене.
В Книге памяти список фамилий и данных 1000 воинов был опубликован на казахском и немецком языках. Казинформ переводит этот текст на русский язык. Предлагаем список сокращений наименований воинских званий, войсковых частей, архивов, предусмотренных в тексте.
Сокращенные воинские звания
ряд. — рядовой
гв.ряд. — гвардии рядовой
ефр. — ефрейтор
гв.ефр. — гвардии ефрейтор
мл.с-т. — младший сержант
гв.мл.с-т. — гвардии младший сержант
с-т. — сержант
гв.с-т. гвардии сержант
ст. с-т. — старший сержант
гв.ст. с-т. — гвардии ст. сержант
ст-на — старшина
гв.ст-на. — гвардии старшина
мл.л-т. — младший лейтенант
гв.мл.л-т. — гвардии младший лейтенант
л-т.
— лейтенант
гв.л-т. — гвардии лейтенант
ст. л-т. — старший лейтенант
гв.ст.л-т. — гвардии старший лейтенант
к-н — капитан
гв.к-н — гвардии капитан
м-р — майор
гв.м-р. — гвардии майор
п/п-к — подполковник
гв.п/п-к — гвардии подполковник
п-к — полковник
гв.п-к. — гвардии полковник
Сокращенные названия войсковых частей
Красная Армия — Красная Армия
ГТАрмия — Гвардейская танковая армия
Корп — Корпус
Гкорп — Гвардейский корпус
СКорп — Стрелковый корпус
ГАКорп — Гвардейский стрелковый корпус
мехКорп — Механизированный корпус
ГмехКорп — Гвардейский механизированный корпус
ТКорп — Танковый корпус
ГТКорп — Гвардейский танковый корпус
Д — Дивизия
ГД — Гвардейская дивизия
СД — Стрелковая дивизия
ГСД — Гвардейская стрелковая дивизия
ПД — Пехотная дивизия
ГПД — Гвардейская пехотная дивизия
ВДД — Воздушно-десантная дивизия
ГВДД — Гвардейская воздушно-десантная дивизия
КавД — Кавалерийская дивизия
ГКавД — Гвардейская кавалерийская дивизия
АртД — Артиллерийская дивизия
ГАртД — Гвардейская артиллерийская дивизия
мехАртД — Механизированная артиллерийская дивизия
ГмехАртД — Гвардейская механизированная артиллерийская дивизия
Бр — Бригада
ГБр — Гвардейская бригада
ТБр — Танковая бригада
ГТБр — Гвардейская Танковая бригада
мехБр — Механизированная бригада
ГмехБр — Гвардейская механизированная бригада
АртБр — Артиллерийская бригада
ГАртБр — Гвардейская артиллерийская бригада
мотАртБр — Моторизованная артиллерийская бригада
ГмотАртБр — Гвардейская моторизованная артиллерийская бригада
мехАртБр -Механизированная артиллерийская бригада
ГмехАртБр — Гвардейская механизированная артиллерийская бригада
мехСБр -Механизированная стрелковая бригада
ГмехАБр — Гвардейская механизированная стрелковая бригада
мотАБр — Моторизованная стрелковая бригада
ГмотАБр — Гвардейская моторизованная стрелковая бригада
СапБр -Саперная бригада
ГСапБр — Гвардейская саперная бригада
П -Полк
ГП — Гвардейский полк
СП — Стрелковый полк
ГАП — Гвардейский стрелковый полк
АртП -Артиллерийский полк
ГАртП — Гвардейский артиллерийский полк
мехАртП — Механизированный артиллерийский полк
ГмехАртП — Гвардейский механизированный артиллерийский полк
ВДП — Воздушно-десантный полк
ГВДП — Гвардейский воздушно-десантный полк
ПП — Пехотный полк
ГПП — Гвардейский пехотный полк
ТП — Танковый полк
ГТП — Гвардейский танковый полк
мотП — Моторизованный полк
ГмотП — Гвардейский моторизованный полк
КавП — Кавалерийский полк
ГКавП — Гвардейский кавалерийский полк
ШП — Штрафной полк
Бат — Батальон
мотБат — Моторизованный батальон
СапБат — Саперный батальон
ГСапБат — Гвардейский саперный батальон
МедСанБат — Медицинский санитарный батальон
Р — Рота
СР — Стрелковая рота
ГСР — Гвардейская стрелковая рота
ТР — Танковая рота
ГТР — Гвардейская танковая рота
мехР — Механизированная рота
ГмехР — Гвардейская механизированная рота
ШР — Штрафная Рота
Полевая почта — Полевая почта
ВП — Военнопленный
Z — Центральный архив Министерства обороны
РГВА — Российский государственный военный архив
Советские перезахоронения в Австрии 1949 г.
— Советские перезахоронения в Австрии 1949 г.
ВА РК — Военный архив Республики Казахстан
Акмолинская область — список погибших из Акмолинской области
Чтобы ознакомиться со списком, необходимо кликнуть по баннеру «Список сражавшихся и погибших воинов-казахстанцев в Австрии», который размещен на главной странице сайта www.inform.kz, www.kazinform.kz
Поделиться:
Подписывайтесь на наш канал
Многолокусное типирование последовательностей | ПубликацияMLST
Многолокусное типирование последовательностей (MLST) — это однозначная процедура для характеристики изолятов бактериальных видов с использованием последовательностей внутренних фрагментов (обычно) семи генов домашнего хозяйства. Используются внутренние фрагменты каждого гена размером примерно 450–500 п.н., поскольку их можно точно секвенировать на обеих цепях с помощью автоматического секвенатора ДНК..png)
Таким образом, каждый изолят вида однозначно характеризуется серией из семи целых чисел, которые соответствуют аллелям в семи локусах домашнего хозяйства.
В MLST количество нуклеотидных различий между аллелями игнорируется, и последовательностям присваиваются разные номера аллелей независимо от того, различаются ли они в одном нуклеотидном сайте или во многих сайтах. Обоснование состоит в том, что одно генетическое событие, приводящее к появлению нового аллеля, может произойти в результате точечной мутации (изменение только одного нуклеотидного сайта) или рекомбинационной замены (которая часто меняет несколько сайтов) — взвешивание в соответствии с количеством нуклеотидных различий. между аллелями будет ошибочно считать, что аллель более различен, чем при рассмотрении изменений нуклеотидов как единого генетического события.
Большинство видов бактерий имеют достаточную изменчивость генов «домашнего хозяйства», чтобы обеспечить множество аллелей на локус, что позволяет различать миллиарды различных аллельных профилей с использованием семи локусов «домашнего хозяйства». Например, в среднем 30 аллелей на локус позволяют разрешить около 20 миллиардов генотипов.
MLST основан на хорошо зарекомендовавших себя принципах многолокусного электрофореза ферментов, но отличается тем, что присваивает аллели в нескольких локусах домашнего хозяйства непосредственно путем секвенирования ДНК, а не косвенно, посредством электрофоретической подвижности их генных продуктов.
Большим преимуществом MLST является то, что данные о последовательности являются однозначными, а аллельные профили изолятов можно легко сравнить с профилями в большой центральной базе данных через Интернет (в отличие от большинства процедур типирования, которые включают сравнение размеров фрагментов ДНК на гелях). Аллельные профили также можно получить из клинического материала с помощью ПЦР-амплификации семи локусов «домашнего хозяйства» непосредственно из спинномозговой жидкости или крови.
Таким образом, изоляты можно точно охарактеризовать, даже если их невозможно выделить из клинического материала.
- Maiden MC и др. 1998. Мультилокусное типирование последовательности: портативный подход к идентификации клонов в популяциях патогенных микроорганизмов. Proc Natl Acad Sci USA , 95: 3140-3145.
- Urwin R & Maiden MC 2003. Мультилокусное типирование последовательности: инструмент для глобальной эпидемиологии. Trends Microbiol , 11: 479-487.
- Maiden MC 2006, Многолокусное типирование последовательностей бактерий. Анну Рев Микробиол 60: 561-588.
- Maiden MC и др. 2013. Новый взгляд на MLST: погенный подход к бактериальной геномике. Nat Rev Microbiol 11: 728-736.
- Jolley KA, Bray JE & Maiden MC 2018. Геномика бактериальной популяции в открытом доступе: программное обеспечение BIGSdb, веб-сайт PubMLST.
org и их приложения. Открытое разрешение Wellcome 3: 124
org и их приложения. Открытое разрешение Wellcome 3: 124Новый взгляд на MLST: погенный подход к бактериальной геномике
Ciccarelli, F.D. et al. К автоматической реконструкции древа жизни с высоким разрешением. Наука 311 , 1283–1287 (2006).
Артикул КАС пабмед Google Scholar
Медини, Д. и др. Микробиология в постгеномную эпоху. Nature Rev. Microbiol. 6 , 419–430 (2008).
Артикул КАС Google Scholar
Rusch, D.B. et al. Экспедиция Sorcerer II Global Ocean Sampling: северо-западная Атлантика через восточную тропическую часть Тихого океана. PLoS Биол. 5 , e77 (2007 г.).
Артикул пабмед ПабМед Центральный КАС Google Scholar
Фурнье, П.
Э. и Рауль, Д. Перспективы использования геномики и протеомики в клинической микробиологии. Год. Преподобный Микробиолог. 65 , 169–188 (2011).
Артикул КАС пабмед Google Scholar
Stackebrandt, E. et al. Отчет специального комитета по переоценке определения вида в бактериологии. Междунар. Дж. Сист. Эвол. микробиол. 52 , 1043–1047 (2002).
КАС пабмед Google Scholar
Кох Р. Адрес по бактериологическим исследованиям. Бр. Мед. J. 2 , 380–383 (1890).
Артикул пабмед ПабМед Центральный КАС Google Scholar
Fraser, C., Alm, E.J., Polz, M.F., Spratt, B.G. & Hanage, W.P. Проблема видов бактерий: осмысление генетического и экологического разнообразия. Наука 323 , 741–746 (2009).
Артикул КАС пабмед Google Scholar
Buckee, C. O. et al. Роль отбора в появлении линий и эволюции вирулентности у Neisseria meningitidis . Проц. Натл акад. науч. США 105 , 15082–15087 (2008 г.).
Артикул КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar
Бентли С.Д. и Паркхилл Дж. Сравнительная геномная структура прокариот. Год. Преподобный Жене. 38 , 771–792 (2004).
Артикул КАС пабмед Google Scholar
Теттелин Х., Райли Д., Каттуто К. и Медини Д. Сравнительная геномика: бактериальный пангеном. Курс. мнение микробиол. 11 , 472–477 (2008).
Артикул КАС пабмед Google Scholar
Woese, C.
R., Kandler, O. & Wheelis, ML. На пути к естественной системе организмов — предложение для доменов Archaea, Bacteria и Eucarya. Проц. Натл акад. науч. США 87 , 4576–4579 (1990).
Артикул КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar
Fox, G. E. et al. Филогения прокариот. Наука 209 , 457–463 (1980).
Артикул КАС пабмед Google Scholar
Кларридж, Дж. Э. Влияние анализа последовательности гена 16S рРНК для идентификации бактерий на клиническую микробиологию и инфекционные заболевания. клин. микробиол. 17 , 840–862 (2004).
Артикул пабмед ПабМед Центральный КАС Google Scholar
Вамози, С. М., Херд, С. Б., Вамози, Дж. К. и Уэбб, К. О. Новые закономерности в сравнительном анализе филогенетической структуры сообщества.
Мол. Экол. 18 , 572–592 (2009).
Артикул КАС пабмед Google Scholar
Hugenholtz, P., Goebel, B.M. & Pace, N.R. Влияние независимых от культуры исследований на возникающие филогенетические представления о бактериальном разнообразии. J. Бактериол. 180 , 4765–4774 (1998).
ПабМед ПабМед Центральный КАС Google Scholar
Sabat, A.J. et al. Обзор методов молекулярного типирования для выявления вспышек и эпидемиологического надзора. Евронаблюдение 18 , 17–30 (2013).
Артикул Google Scholar
Maiden, M.C.J. et al. Мультилокусное типирование последовательности: портативный подход к идентификации клонов в популяциях патогенных микроорганизмов. Проц. Натл акад. науч. США 95 , 3140–3145 (1998).
Артикул КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar
Перес-Лосада М., Кабесас П., Кастро-Наллар Э. и Крэндалл К. А. Типирование патогенов в эпоху геномики: MLST и будущее молекулярной эпидемиологии. Генетическая инфекция. Эвол. 16 , 38–53 (2013).
Артикул КАС Google Scholar
Мейнард Смит, Дж., Смит, Н. Х., О’Рурк, М. и Спратт, Б. Г. Насколько клональны бактерии? Проц. Натл акад. науч. США 90 , 4384–4388 (1993).
Артикул Google Scholar
Maiden, M.C.J. Многолокусное типирование последовательности бактерий. Год. Преподобный Микробиолог. 60 , 561–588 (2006).
Артикул КАС пабмед Google Scholar
Selander, R.
K. et al. Методы мультилокусного электрофореза ферментов для генетики и систематики популяций бактерий. Заяв. Окружающая среда. микробиол. 51 , 837–884 (1986).
Google Scholar
Дидело, X. и Мейден, М.С. Влияние рекомбинации на эволюцию бактерий. Тенденции микробиол. 18 , 315–322 (2010).
Артикул пабмед ПабМед Центральный КАС Google Scholar
Тернер, К. М. и Фейл, Э. Дж. Тайная жизнь многолокусного типа последовательности. Междунар. Дж. Антимикроб. Агенты 29 , 129–135 (2007).
Артикул КАС пабмед Google Scholar
До, Т. и др. Популяционная структура Streptococcus oralis . Микробиология 155 , 2593–2602 (2009).
Артикул пабмед ПабМед Центральный КАС Google Scholar
Webb, K.
et al. Разработка однозначной и дискриминационной схемы мультилокусного типирования последовательности Группа зооэпидемических стрептококков . Микробиология 154 , 3016–3024 (2008).
Артикул КАС пабмед Google Scholar
Coffey, T.J. et al. Первые сведения об эволюции Streptococcus uberis: схема многолокусного типирования последовательности, позволяющая исследовать биологию его популяции. Заяв. Окружающая среда. микробиол. 72 , 1420–1428 (2006).
Артикул пабмед ПабМед Центральный КАС Google Scholar
Enright, M.C. & Spratt, B.G. Схема многолокусного типирования последовательности для Streptococcus pneumoniae: идентификация клонов, связанных с серьезным инвазивным заболеванием. Микробиология 144 , 3049–3060 (1998).
Артикул КАС пабмед Google Scholar
Прист, Ф.
Г., Баркер, М., Бэйли, Л.В., Холмс, Э.К. и Мейден, М.К. Структура популяции и эволюция группы Bacillus cereus . J. Бактериол. 186 , 7959–7970 (2004 г.).
Артикул пабмед ПабМед Центральный КАС Google Scholar
Ахтман, М. и др. Микроэволюция и история чумной палочки Yersinia pestis . Проц. Натл акад. науч. США 101 , 17837–17842 (2004 г.).
КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar
Джолли К.А. и др. Разрешение вспышки менингококковой инфекции на основе данных о последовательностях всего генома с помощью методов быстрого веб-анализа. Дж. Клин. микробиол. 50 , 3046–3053 (2012).
Артикул пабмед ПабМед Центральный Google Scholar
Холт, К.
Э. и др. Высокопроизводительное секвенирование дает представление об изменчивости и эволюции генома Salmonella Typhi. Природа Жене. 40 , 987–993 (2008).
Артикул КАС пабмед Google Scholar
Джолли, К. А., Брехони, К. и Мейден, М. С. Молекулярное типирование менингококков: рекомендации по выбору мишени и номенклатура. FEMS микробиол. Откр. 31 , 89–96 (2007).
Артикул КАС пабмед Google Scholar
Dingle, K.E., McCarthy, N.D., Cody, A.J., Peto, T.E. & Maiden, M.C. Расширенное типирование последовательности Campylobacter spp., Соединенное Королевство. Аварийный. Заразить. Дис. 14 , 1620–1622 (2008).
Артикул пабмед ПабМед Центральный Google Scholar
Adair, D.
M. et al. Разнообразие в тандемном повторе с переменным числом от Yersinia pestis . Дж. Клин. микробиол. 38 , 1516–1519 (2000).
ПабМед ПабМед Центральный КАС Google Scholar
Паркхилл, Дж. и Рен, Б.В. Бактериальная эпидемиология и биология — уроки секвенирования генома. Геном Биол. 12 , 230 (2011).
Артикул пабмед ПабМед Центральный Google Scholar
Паллен, М. Дж., Ломан, Н. Дж. и Пенн, К. В. Высокопроизводительное секвенирование и клиническая микробиология: прогресс, возможности и проблемы. Курс. мнение микробиол. 13 , 625–631 (2010).
Артикул КАС пабмед Google Scholar
Дидело X., Боуден Р., Уилсон Д. Дж., Пето Т. Е. А. и Крук Д. В. Преобразование клинической микробиологии с помощью секвенирования бактериального генома.
Природа Преподобный Жене. 13 , 601–612 (2012).
Артикул КАС пабмед Google Scholar
Ломан, Нью-Джерси и др. Высокопроизводительное секвенирование бактериального генома: смущение выбора, мир возможностей. Nature Rev. Microbiol. 10 , 599–606 (2012).
Артикул КАС Google Scholar
Джунманн, С. и др. Обновление сравнения производительности настольного секвенирования. Природные биотехнологии. 31 , 294–296 (2013).
Артикул КАС Google Scholar
Краучер, Н. Дж., Харрис, С. Р., Град, Ю. Х. и Ханаге, В. П. Бактериальные геномы в эпидемиологии — настоящее и будущее. Филос. Транс. Р. Соц. В 368 , 20120202 (2013).
Артикул Google Scholar
Köser, C.
U. et al. Быстрое полногеномное секвенирование для расследования вспышки MRSA у новорожденных. Новый англ. Дж. Мед. 366 , 2267–2275 (2012).
Артикул пабмед Google Scholar
Eyre, D.W. et al. Пилотное исследование быстрого настольного секвенирования Staphylococcus aureus и Clostridium difficile для выявления вспышек и эпиднадзора. BMJ Open 2 , e001124 (2012).
Артикул пабмед ПабМед Центральный Google Scholar
Harris, S. R. et al. Полногеномное секвенирование для анализа вспышки метициллин-резистентного Staphylococcus aureus : описательное исследование. Ланцет Заражение. Дис. 31 , 130–136 (2012).
Google Scholar
McAdam, P. R. et al. Молекулярное отслеживание появления, адаптации и передачи внутрибольничного метициллин-резистентного Staphylococcus aureus .
Проц. Натл акад. науч. США 109 , 9107–9112 (2012 г.).
Артикул КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar
Холден, М. Т. и др. Геномный портрет возникновения, эволюции и глобального распространения пандемии устойчивых к метициллину Staphylococcus aureus . Рез. генома. 23 , 653–664 (2013).
Артикул пабмед ПабМед Центральный КАС Google Scholar
Young, B.C. et al. Эволюционная динамика Staphylococcus aureus при переходе от носительства к заболеванию. Проц. Натл акад. науч. США 109 , 4550–4555 (2012 г.).
Артикул КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar
Mutreja, A. et al. Доказательства нескольких волн глобальной передачи во время седьмой пандемии холеры.
Природа 477 , 462–465 (2011).
Артикул пабмед ПабМед Центральный КАС Google Scholar
Брайант, Дж. М. и др. Полногеномное секвенирование для выявления передачи Mycobacterium abscessus между пациентами с муковисцидозом: ретроспективное когортное исследование. Ланцет 381 , 1551–1560 (2013).
Артикул пабмед ПабМед Центральный КАС Google Scholar
Хе, М. и др. Эволюционная динамика Clostridium difficile в краткосрочном и долгосрочном масштабах. Проц. Натл акад. науч. США 107 , 7527–7532 (2010 г.).
Артикул КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar
Cui, Y. J. et al. Исторические изменения частоты мутаций у эпидемического патогена Yersinia pestis .
Проц. Натл акад. науч. США 110 , 577–582 (2013).
Артикул КАС пабмед Google Scholar
Walker, T. M. et al. Полногеномное секвенирование для выявления вспышек Mycobacterium tuberculosis : ретроспективное обсервационное исследование. Ланцет Заражение. Дис. 13 , 137–146 (2013).
Артикул пабмед ПабМед Центральный КАС Google Scholar
Град, Ю. Х. и др. Геномная эпидемиология вспышек Escherichia coli O104:h5 в Европе, 2011 г. Proc. Натл акад. науч. США 109 , 3065–3070 (2012).
Артикул КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar
Икбал З., Тернер И. и Маквин Г. Геномика популяций микробов с высокой пропускной способностью с использованием ассемблера вариаций Cortex.
Биоинформатика 29 , 275–276 (2013).
Артикул КАС пабмед Google Scholar
Джолли, К. А. и Мейден, М. С. Автоматическое извлечение информации о типировании бактериальных патогенов из данных о последовательностях всего генома: Neisseria meningitidis в качестве примера. Евронаблюдение. 18 , 20379 (2013).
Артикул пабмед КАС Google Scholar
Шеппард, С.К., Джолли, К.А. и Мейден, М.С.Дж. Геномный подход к геномике бактериальной популяции: MLST всего генома Campylobacter . Гены 3 , 261–277 (2012).
Артикул пабмед ПабМед Центральный Google Scholar
Братчер, Х. Б., Беннетт, Дж. С. и Мейден, М. С. Дж. Эволюционные и геномные взгляды на менингококковую биологию.
Будущая микробиология. 7 , 873–885 (2012).
Артикул пабмед КАС Google Scholar
Константинидис, К. Т. и Тидже, Дж. М. Тенденции между содержанием генов и размером генома у прокариотических видов с более крупными геномами. Проц. Натл акад. науч. США 101 , 3160–3165 (2004 г.).
Артикул КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar
Зербино, Д. Р. и Бирни, Э. Вельвет: алгоритмы сборки de novo с коротким чтением с использованием графов де Брейна. Рез. генома. 18 , 821–829 (2008).
Артикул пабмед ПабМед Центральный КАС Google Scholar
Цепь, П. С. и др. Геномика. Стандарты геномных проектов в новую эру секвенирования. Наука 326 , 236–237 (2009).
Артикул КАС пабмед Google Scholar
Хант, М. и др. REAPR: универсальный инструмент для оценки сборки генома. Геном Биол. 14 , Р47 (2013).
Артикул пабмед ПабМед Центральный Google Scholar
Enright, M.C. et al. Эволюционная история метициллин-резистентного Staphylococcus aureus (MRSA). Проц. Натл акад. науч. США 99 , 7687–7692 (2002).
Артикул КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar
Хармсен Д., Ротгангер Дж., Фрош М. и Альберт Дж. RIDOM: база данных рибосомной дифференциации медицинских микроорганизмов. Рез. нуклеиновых кислот. 30 , 416–417 (2002).
Артикул пабмед ПабМед Центральный КАС Google Scholar
Koser, C.
U. et al. Рутинное использование секвенирования полного генома микробов в диагностической и медицинской микробиологии. PLoS Патог. 8 , e1002824 (2012).
Артикул пабмед ПабМед Центральный КАС Google Scholar
Aarestrup, F. M. et al. Интеграция информатики на основе генома для модернизации глобального мониторинга заболеваний, обмена информацией и реагирования. Аварийный. Заразить. Дис. 18 , e1 (2012).
Артикул пабмед ПабМед Центральный Google Scholar
Каррико, Дж. А., Сабат, А. Дж. и Фридрих, А. В., Рамирес, М. и Исследовательская группа ESCMID по эпидемиологическим маркерам (ESGEM). Биоинформатика в бактериальной молекулярной эпидемиологии и общественном здравоохранении: базы данных, инструменты и революция секвенирования следующего поколения. Евронаблюдение. 18 , 32–40 (2013).
Артикул Google Scholar
Чан, М.С., Мейден, М.К. и Спратт, Б.Г. Мультилокусное типирование последовательностей (MLST) бактериальных патогенов на основе базы данных. Биоинформатика 17 , 1077–1083 (2001).
Артикул КАС пабмед Google Scholar
Джолли, К. А., Чан, М. С. и Мейден, М. С. mlstdbNet — базы данных распределенного многолокусного типирования последовательностей (MLST). BMC Bioinformatics 5 , 86 (2004).
Артикул пабмед ПабМед Центральный КАС Google Scholar
Ааненсен, Д. М. и Спратт, Б. Г. Сеть мультилокусного типирования последовательностей: mlst.net. Рез. нуклеиновых кислот. 33 , W728–W733 (2005 г.).
Артикул пабмед ПабМед Центральный КАС Google Scholar
Джолли, К.
А. и Мейден, М. С. BIGSdb: масштабируемый анализ вариаций бактериального генома на уровне популяции. BMC Bioinformatics 11 , 595 (2010).
Артикул пабмед ПабМед Центральный Google Scholar
Джолли, К. А. и Мейден, М. С. AgdbNet — программное обеспечение базы данных последовательностей антигенов для бактериального типирования. BMC Bioinformatics 7 , 314 (2006).
Артикул пабмед ПабМед Центральный КАС Google Scholar
Markowitz, V.M. et al. Интегрированная система микробных геномов: расширяющийся ресурс сравнительного анализа. Рез. нуклеиновых кислот. 38 , Д382–Д390 (2010 г.).
Артикул КАС пабмед Google Scholar
Altschul, S. F. et al. Gapped BLAST и PSI-BLAST: новое поколение программ поиска белковых баз данных.
Рез. нуклеиновых кислот. 25 , 3389–3402 (1997).
Артикул пабмед ПабМед Центральный КАС Google Scholar
Брайант Д. и Моултон В. Сеть соседей: агломеративный метод построения филогенетических сетей. Мол. биол. Эвол. 21 , 255–265 (2004).
Артикул КАС пабмед Google Scholar
Хьюсон Д. Х. SplitsTree: анализ и визуализация эволюционных данных. Биоинформатика 14 , 68–73 (1998).
Артикул КАС пабмед Google Scholar
Джолли, К. А. и др. Рибосомное многолокусное типирование последовательностей: универсальная характеристика бактерий от домена до штамма. Микробиология 158 , 1005–1015 (2012).
Артикул пабмед ПабМед Центральный КАС Google Scholar
Ютин Н.
, Пучбо П., Кунин Е. В. и Вольф Ю. И. Филогеномика прокариотических рибосомных белков. ПЛОС ОДИН 7 , е36972 (2012).
Артикул пабмед ПабМед Центральный КАС Google Scholar
Ву, М. и Эйзен, Дж. А. Простой, быстрый и точный метод филогеномного вывода. Геном Биол. 9 , R151 (2008 г.).
Артикул пабмед ПабМед Центральный КАС Google Scholar
Bennett, J.S. et al. Геномный подход к таксономии бактерий: исследование и предлагаемая реклассификация видов в пределах рода Нейссерия . Микробиология 158 , 1570–1580 (2012).
Артикул пабмед ПабМед Центральный КАС Google Scholar
Cody, A.J. et al. Геномная эпидемиология изолятов Campylobacter человека в режиме реального времени с использованием мультилокусного типирования последовательности всего генома.
Дж. Клин. микробиол. 51 , 2526–2534 (2013).
Артикул пабмед ПабМед Центральный КАС Google Scholar
Стефани, С. и др. Метициллин-резистентный штамм Staphylococcus aureus (MRSA): глобальная эпидемиология и гармонизация методов типирования. Междунар. Дж. Антимикроб. Агенты 39 , 273–282 (2012).
Артикул КАС пабмед Google Scholar
Widerstrom, M., Wistrom, J., Sjostedt, A. & Monsen, T. Коагулазоотрицательные стафилококки: обновленная информация о молекулярной эпидемиологии и клинической картине с акцентом на Staphylococcus epidermidis и Staphylococcus saprophyticus . евро. Дж. Клин. микробиол. Заразить. Дис. 31 , 7–20 (2012).
Артикул КАС пабмед Google Scholar
Harris, S.
R. et al. Эволюция MRSA при внутрибольничной передаче и межконтинентальном распространении. Наука 327 , 469–474 (2010).
Артикул пабмед ПабМед Центральный КАС Google Scholar
Линдси, Дж. А. Геномная изменчивость и эволюция Staphylococcus aureus . Междунар. Дж. Мед. микробиол. 300 , 98–103 (2010).
Артикул КАС пабмед Google Scholar
Улеманн, А. К., Отто, М., Лоуи, Ф. Д. и Делео, Ф. Р. Эволюция устойчивых к метициллину Staphylococcus aureus , связанных с общественными и медицинскими учреждениями. Заразить. Жене. Эвол. http://dx.doi.org/10.1016/j.meegid.2013.04.030 (2013 г.).
Fitzgerald, J. R. Связанный с домашним скотом Staphylococcus aureus : происхождение, эволюция и угроза общественному здоровью.
Тенденции микробиол. 20 , 192–198 (2012).
Артикул КАС пабмед Google Scholar
Фитцджеральд, Дж. Р. Эволюция Staphylococcus aureus во время колонизации человека и инфицирования. Заразить. Жене. Эвол. http://dx.doi.org/10.1016/j.meegid.2013.04.020 (2013 г.).
Линдси, Дж. А. Эволюция Staphylococcus aureus и MRSA во время вспышек. Заразить. Жене. Эвол. http://dx.doi.org/10.1016/j.meegid.2013.04.017 (2013 г.).
Сун, Дж. С., Чун, Дж., Чой, С. и Парк, В. Геномная последовательность галотолерантного штамма Staphylococcus sp. штамм OJ82, выделенный из корейских традиционных соленых морепродуктов. J. Бактериол. 194 , 6353–6354 (2012).
Артикул пабмед ПабМед Центральный КАС Google Scholar
Чонг, Т.
М., Тунг, Х. Дж., Инь, В. Ф. и Чан, К. Г. Анализ последовательности генома подавления кворума Staphylococcus sp. штамм AL1, выделенный в результате ферментации рассола традиционного китайского соевого соуса. J. Бактериол. 194 , 6611–6612 (2012).
Артикул пабмед ПабМед Центральный КАС Google Scholar
Holt, D.C. et al. Очень ранневетвящаяся линия Staphylococcus aureus , лишенная каротиноидного пигмента стафилоксантина. Геном Биол. Эвол. 3 , 881–895 (2011).
Артикул пабмед ПабМед Центральный КАС Google Scholar
Милкман, Р. и Маккейн, М. в Population Genetics of Bacteria (ред. Baumberg, S., Young, J.P.W., Wellington, E.M.H. & Saunders, J.R.) 127–142 (Cambridge Univ. Press, 1995).
Google Scholar
Lapage, S.
